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AI+藥物研發(fā)的機遇與挑戰(zhàn)

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作者:海納百川  來源:藥渡
  2019-10-12
新藥研發(fā)具有成本高、研發(fā)周期長、成功率低三大高風險性質(zhì)。據(jù)《Natrue》報道,新藥研發(fā)成本約為26億美元,耗時約10年,成功率不到1/10。如何加速新藥研發(fā)進程,降低研發(fā)費用已成為各大制藥公司迫切需要解決的問題。此外,藥品流通環(huán)節(jié)及醫(yī)療價值鏈的轉(zhuǎn)變,迫使制藥公司降低價格,提升藥物價值。

       新藥研發(fā)具有成本高、研發(fā)周期長、成功率低三大高風險性質(zhì)。據(jù)《Natrue》報道,新藥研發(fā)成本約為26億美元,耗時約10年,成功率不到1/10。如何加速新藥研發(fā)進程,降低研發(fā)費用已成為各大制藥公司迫切需要解決的問題。此外,藥品流通環(huán)節(jié)及醫(yī)療價值鏈的轉(zhuǎn)變,迫使制藥公司降低價格,提升藥物價值。

       如今藥物研發(fā)累計的數(shù)據(jù)高速增長,藥物研發(fā)領域數(shù)字化轉(zhuǎn)型加速。因此,藥企的首要任務在于利用這些數(shù)據(jù)來驅(qū)動價值,達到提高藥品生產(chǎn)效率和審批率,并降低成本的最終目標。

       最近為學習和預測新特征而建立的人工智能技術,尤其是深度神經(jīng)網(wǎng)絡(DNNs)或遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(RNNs)等的進步,讓人工智能技術應用更為廣泛,社會自動化程度提速。在此大背景環(huán)境之下,與大數(shù)據(jù)、云計算相結合的人工智能技術在藥物研發(fā)中的應用日益增多,應用優(yōu)勢也得到突出體現(xiàn)。

       AI+藥物研發(fā)應用情景與技術

       從1956年的達特茅斯會議開始,AI在藥物研發(fā)中的應用已有60多年的歷史,現(xiàn)在已滲入醫(yī)藥研發(fā)各個階段,但還主要集中在新藥發(fā)現(xiàn)和驗證階段。不過應用的技術已有很大進步,已從以前定量關系的(QSAR)和定量結構-性質(zhì)關系(QSPR)的研究中的標記訓練數(shù)據(jù)集和模型進步到機器學習、認知計算和圖像識別等。

       現(xiàn)在,AI與藥物研發(fā)相結合應用的主要場景包括:發(fā)掘藥物靶點、挖掘候選藥物、高通量篩選、藥物設計、藥物合成、預測藥物ADMET性質(zhì)、病理生理學研究及新適應癥的開發(fā)——老藥新用。其中靶點篩選是近期AI+藥物研發(fā)最熱門的領域,而兩者相結合的應用也將讓老藥新用達到新高度,但小分子藥物篩選和設計仍然占主要地位。但按照應用場景的發(fā)展速度來看,藥物合成未來或?qū)⒊勺詣踊潭茸罡叩姆较?。這些應用場景常用的AI技術主要是機器學習、認知計算和圖像識別等。

       AI+藥物研發(fā)代表企業(yè)和布局領域

       目前,AI+藥物研發(fā)代表性的初創(chuàng)企業(yè)有Exscientia、BenevolentAI、Atomwise、Relay Therapeutics、晶泰科技、燧坤智能、Numerate和IBM Waston和Lam Therapeutics等。按照現(xiàn)有初創(chuàng)企業(yè)在治療領域的布局情況來看,腫瘤占比最多,而神經(jīng)領域次之,而罕見病相關的企業(yè)也較多。因此,腫瘤和神經(jīng)系統(tǒng)不僅是目前AI+藥物研發(fā)的布局重點領域,也是未來發(fā)展的潛力領域,而AI也將助力破解罕見病診斷難和藥物研發(fā)難的“兩難”境地。

 AI+藥物研發(fā)初創(chuàng)企業(yè)治療領域布局情況

       圖1. AI+藥物研發(fā)初創(chuàng)企業(yè)治療領域布局情況

       數(shù)據(jù)來源:biopharmatrend,數(shù)據(jù)截止時間為2019年7月底

       AI+藥物研發(fā)優(yōu)勢及代表實例

       與傳統(tǒng)藥物研發(fā)模式相比,AI+藥物研發(fā)具有縮短研發(fā)周期,節(jié)約資金成本,提高成功率,充分利用現(xiàn)有醫(yī)療資源等優(yōu)勢。據(jù)統(tǒng)計,傳統(tǒng)模式下的藥物研發(fā)光是臨床前階段可能就需要4-5年。而基于AI和生物計算的新藥研發(fā)管線平均1-2年就可以完成臨床前藥物研發(fā),藥物研發(fā)明顯提速。自此,首個完全通過AI設計的藥物-渦輪增壓”的流感**已經(jīng)進入臨床階段。Pharnext公司利用AI技術開發(fā)的治療腓骨肌萎縮癥1A亞型的組合療法PXT3003已完成兩項III期臨床,且取得積極結果。2017年天士力也與Pharnext達成了合作協(xié)議。

       AI+藥物研發(fā)企業(yè)合作情況

       2019年9月11日,江蘇豪森和Atomwise宣布,雙方將合作設計和發(fā)現(xiàn)多個治療領域中多達11種未公開靶蛋白的潛在候選藥物。根據(jù)雙方合作協(xié)議,此次合作對Atomwise的潛在總價值將超15億美元。之前正大天晴通過與阿里云合作獲得一種全新的化合物篩選方法。據(jù)悉與傳統(tǒng)計算機輔助藥物設計方法相比,這套新方法可提高篩選準確率20%。

       再看全球藥企的合作情況,至此,全球十大跨國企業(yè)均已入局AI+藥物研發(fā)領域,具體合作信息如下表所示。因此在AI+研藥物領域,初創(chuàng)企業(yè)布局平臺,通過技術合作盈利,而傳統(tǒng)大型企業(yè)通過合作或者戰(zhàn)略投資入局。在此趨勢之下,初創(chuàng)企業(yè)的涌現(xiàn)、合作和融資情況在2018年均達到了歷史最高,初創(chuàng)企業(yè)融資金額高達10.36億美元(未包括未公開項)。

       AI+藥物研發(fā)所面臨的機遇和挑戰(zhàn)

       來自TechEmergence的一份報告顯示,人工智能可以將新藥研發(fā)的成功率從12%提高到14%,可以為生物制藥行業(yè)節(jié)省數(shù)十億美元。此外,據(jù)報道AI在化合物合成和篩選方面比傳統(tǒng)手段可節(jié)約40%-50%的時間,每年為藥企節(jié)約260億美元的化合物篩選成本。在臨床研究階段,可節(jié)約50%-60%的時間,每年可節(jié)約280億美元的臨床試驗費用。即AI每年能夠為藥企節(jié)約540億美元的研發(fā)費用。AI+藥物研發(fā)與傳統(tǒng)模式相比,時間和成本優(yōu)勢明顯。

       現(xiàn)在,全球十大藥企已入局,而初創(chuàng)企業(yè)融資和合作也達到了歷史最高,領跑著已獲得高額融資回報,而優(yōu)先布局的大型企業(yè)如羅氏也掌握了優(yōu)質(zhì)數(shù)據(jù)源。按此發(fā)展,未來AI+醫(yī)藥這一市場有著巨大的發(fā)展?jié)摿?。?025年,AI+藥物研發(fā)的市場規(guī)模將超37億美元(不包括診療等)。

       但AI+藥物研發(fā)同樣面臨著不太樂觀的現(xiàn)狀及諸多挑戰(zhàn)。2019年4月,IBM公司因為財務業(yè)績低迷,決定停止開發(fā)和銷售藥物開發(fā)工具——Watson人工智能套件。作為醫(yī)藥健康領域人工智能的領跑者,也不得不面對財務業(yè)績低迷的狀態(tài)。

       此外,當下AI應用較為集中的靶點篩選方向,現(xiàn)已通過文獻分析等篩選出比已批準藥物更多的靶點,但是靶點的確證卻是一道難題,如何建立確證模型,又用什么來確證,人力財力是否跟得上,這也是需要思考的。另外,人工預測藥物的可成藥性,與通過試驗摸索得到的藥物相比,可信服度低。因為基于已不到2000個獲批藥物的數(shù)據(jù)集(質(zhì)量未必高)來預測,這是遠遠達不到依賴高質(zhì)量、有標識的數(shù)據(jù)集的深度學習的最基本的要求。而這也恰巧是AI在藥物合成方面的應用優(yōu)勢。

       因此整體來看,AI+藥物研發(fā)真正意義的產(chǎn)出極少,大部分企業(yè)需要面對產(chǎn)出成果不足或者不優(yōu)而導致財務狀況堪憂的現(xiàn)狀。因此,企業(yè)需要合理的定位產(chǎn)業(yè)鏈角色,選擇適合的創(chuàng)新商業(yè)模式。

       此外, AI+藥物研發(fā)的企業(yè)也面臨來自政策、人才、技術等方面的挑戰(zhàn)。新的技術的引進,讓原有藥物研發(fā)模式改變,監(jiān)管人才、政策指南等均需要同步更新,而現(xiàn)在尚無針對性的政策指南出臺。就人才而言,高端復合型人才的缺失也限制了這一領域的發(fā)展。且AI多任務學習的“黑匣子”特征仍是深層神經(jīng)網(wǎng)絡從復雜生物信息中提取關鍵關聯(lián)信息的阻力。未來需要政策監(jiān)管同步提高,培養(yǎng)復合型高端人才,技術方面如自然語言處理實用化發(fā)展、知識圖譜的多維度應用,以及知識問答、分析決策和語義搜索等也需要較大提升。除此之外,對AI+藥物研發(fā)認知度和生物復雜性的理解提升也有待提高。在決定AI+藥物研發(fā)質(zhì)量的數(shù)據(jù)問題中,如何建立研發(fā)數(shù)據(jù)標準體系完善數(shù)據(jù),如何建立風險利益公擔的共享機制,也是未來AI+藥物研發(fā)所需要面對的。

       結語

       雖然AI+醫(yī)藥研發(fā)目前現(xiàn)狀并不是非常樂觀,還面臨諸多挑戰(zhàn),但可以明確的是,AI+藥物研發(fā)的結合必然是未來制藥行業(yè)的發(fā)展趨勢,也將在未來十甚至二十年的時間內(nèi),對醫(yī)藥領域進行一場顛覆性的革命,迎來新時代。

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