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CPHI制藥在線 資訊 液體活檢再進(jìn)階,通過“微衛(wèi)星”高效預(yù)測不限癌種療效,樣本一致性達(dá)98.4%

液體活檢再進(jìn)階,通過“微衛(wèi)星”高效預(yù)測不限癌種療效,樣本一致性達(dá)98.4%

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來源:生物探索
  2019-08-08
隨著DNA測序技術(shù)的發(fā)展,生物分子機制研究的深入,癌癥治療藥物的研發(fā)也不斷推進(jìn)。不限癌種的抗癌療法相繼獲得FDA批準(zhǔn), 但說到首款“不限癌種”療法,還當(dāng)屬默沙東(MSD)公司的重磅PD-1免疫檢查點抑制劑——Keytruda用于治療帶有微衛(wèi)星不穩(wěn)定性高(MSI-H)或錯配修復(fù)缺陷(dMMR)的實體瘤患者 (2017年獲批)。

       隨著DNA測序技術(shù)的發(fā)展,生物分子機制研究的深入,癌癥治療藥物的研發(fā)也不斷推進(jìn)。不限癌種的抗癌療法相繼獲得FDA批準(zhǔn), 但說到首款“不限癌種”療法,還當(dāng)屬默沙東(MSD)公司的重磅PD-1免疫檢查點抑制劑——Keytruda用于治療帶有微衛(wèi)星不穩(wěn)定性高(MSI-H)或錯配修復(fù)缺陷(dMMR)的實體瘤患者 (2017年獲批)。這款重磅藥物自2014年首次獲得FDA批準(zhǔn)治療晚期黑色素瘤以來不斷擴展其適應(yīng)癥,從而發(fā)展成為現(xiàn)在的“不限癌種”。由于它的獲批是FDA首款不依照腫瘤來源,而是依照生物標(biāo)志物——MSI/dMMR進(jìn)行區(qū)分的“不限癌種”療法, 因此具有里程碑式的意義。

       8月5日,專注于開發(fā)癌癥液體活檢的生物技術(shù)公司Guardant Health公司宣布其開發(fā)的Guardant360液體活檢方法可以通過檢測血液中的游離DNA(cell-free DNA——cfDNA)來發(fā)現(xiàn)與不同類型癌癥相關(guān)的MSI,從而有效預(yù)測患者對免疫檢查點抑制劑反應(yīng)。

       MSI是腫瘤免疫治療的重要生物標(biāo)志物

       MS, 即微衛(wèi)星, 一般是由1-6個核苷酸組成的短而重復(fù)的DNA串聯(lián)重復(fù)序列。通常有超過 100000 個MS區(qū)域呈多態(tài)性分布于整個人體基因組中。這些MS在復(fù)制過程中易于出現(xiàn)移位錯誤,因此非常依賴于錯配修復(fù)(MMR)機制來進(jìn)行系統(tǒng)修復(fù)。而MSI,則指微衛(wèi)星不穩(wěn)定性,是由 DNA復(fù)制時插入或缺失突變引起的MS序列長度改變的現(xiàn)象,常由MMR功能缺陷(dMMR)引起。根據(jù)出現(xiàn)頻率,MSI通常劃分為三種狀態(tài):無明顯MSI時為MSS; 頻率>30% 時為微衛(wèi)星不穩(wěn)定性高(MSI-H); 頻率<30%時為微衛(wèi)星不穩(wěn)定性低(MSI-L)。

       1993年,MSI首次在結(jié)直腸癌中首次被發(fā)現(xiàn)。此后,越來越多的證據(jù)表明MSI不僅僅局限于結(jié)直腸癌, 也普遍存在于各類癌癥中。如在2016年,Ronald J Hause等人利用基因組全外顯子測序技術(shù)證實14種癌癥患者癌細(xì)胞中均發(fā)生了MSI,而10個最易發(fā)生MSI的位點普遍存在于各種癌細(xì)胞中。他們同時發(fā)現(xiàn),MSI-H好發(fā)于子宮內(nèi)膜癌 (頻率可高達(dá)30%)、結(jié)直腸癌和胃癌(頻率19%)中。相反,MSI-L與MSS癌癥患者中MSI的分布及頻率較一致。

       近年來,不少研究顯示,MSI能很好地預(yù)測不同類型癌癥中患者對PD-1和PD-L1免疫檢查點抑制劑反應(yīng),是腫瘤免疫治療的重要生物標(biāo)志物。由美國國家綜合癌癥網(wǎng)絡(luò)發(fā)布的權(quán)威指南《NCCN腫瘤學(xué)臨床實踐指南》在2016年版中將MSI納入癌癥檢測建議, 并在2017年版中首次將兩款PD-1單抗推薦用于具有dMMR/MSI-H分子表型的轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌(mCRC)的末線治療。

       然而,目前臨床上對MSI這一重要生物標(biāo)志物的檢測往往需要傳統(tǒng)組織活檢來實現(xiàn),可以通過或聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction, PCR) 直接檢測 MSI序列變化,或是通過免疫組織化學(xué)法(immunohistochemistry, IHC) 間接檢測 MMR 異常蛋白(即檢測dMMR)來判斷MSI。但因為組織活檢侵入性和可及性的問題,這一方法無法成為篩查的有效工具。

       液體活檢為MSI檢測帶來新途徑

       此次,由美國GuardantHealth 公司、德州大學(xué) MD Anderson 癌癥研究中心、Samsung 醫(yī)療中心以及其它研究機構(gòu)共同合作的研究項目,在MSI液體活檢上有了新的突破,相關(guān)研究結(jié)果已發(fā)表在《Clinical Cancer Research》上。

       該項目是目前為止規(guī)模的針對MSI的液體活檢與組織活檢的對比研究。研究人員采用Guardant360液體活檢對1145個癌癥患者的血液ctDNA樣本進(jìn)行了MSI狀態(tài)檢測, 并與已有的標(biāo)準(zhǔn)組織活檢結(jié)果進(jìn)行比較。結(jié)果顯示,MSI狀態(tài)在Guardant360液體活檢與組織活檢中獲得了98.4%一致性。此外,在16名液體活檢發(fā)現(xiàn)MSI-H的晚期胃癌患者中,免疫檢查點抑制劑治療達(dá)到63%的客觀緩解率和81%的疾病控制率。這與通過標(biāo)準(zhǔn)組織檢測方法的結(jié)果相似。

       “在整個基因組中有上百萬個MS,但是大部分都不適合用于血液臨床基因組分析,”這項研究的負(fù)責(zé)人之一,德克薩斯大學(xué)胃腸道腫瘤內(nèi)科教授Scott Kopetz博士說:“我們的結(jié)果表明,使用精心設(shè)計的探針組合,與有效的DNA捕捉技術(shù)和復(fù)雜的生物信息學(xué)工具相結(jié)合,我們能夠準(zhǔn)確、敏感地發(fā)現(xiàn)MSI。”

       事實上,早在今年2月德克薩斯大學(xué)MD Anderson癌癥中心的一項研究就已經(jīng)提示了Guardant360液體活檢方法在發(fā)現(xiàn)與不同類型癌癥相關(guān)的基因突變和其它生物標(biāo)志物上的巨大潛力。他們的結(jié)果顯示Guardant360用于發(fā)現(xiàn)與非小細(xì)胞肺癌相關(guān)的7種基因突變的識別率與從患者肺部手術(shù)獲取組織進(jìn)行的組織活檢相仿。

       結(jié)語

       Guardant360的研究結(jié)果讓液體活檢篩查MSI狀態(tài)有望成為癌癥患者的常規(guī)檢查和幫助“不限癌種”抗癌療法篩查癌癥患者的重要工具。同時,在二代三代基因測序的輔助下,一次性檢測與多個“不限癌種”的不同基因變異有望在同一測試中完成。

       參考資料:

       [1] Largest Study of its Kind Finds Guardant360 MSI Highly Concordant to Tissue.

       [2] Blood test could replace biopsy for rare cancer treated by Keytruda

       [3] Validation of Microsatellite Instability Detection Using a Comprehensive Plasma-Based Genotyping Panel

       [4]Microsatellite instability as a biomarker for PD-1 blockade

       [5] 默沙東重磅PD-1抑制劑“狙殺”小細(xì)胞肺癌;羅氏 “不限癌種”個體化療法全球首獲批

       [6] 深度解析:關(guān)于MSI(微衛(wèi)星不穩(wěn)定性)

       [7] 長文 | 關(guān)于MSI(微衛(wèi)星不穩(wěn)定性)你需要知道的都在這兒!

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