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CPHI制藥在線 資訊 機器學(xué)習(xí)加快球型核酸合成 助力新藥研發(fā)

機器學(xué)習(xí)加快球型核酸合成 助力新藥研發(fā)

來源:藥明康德AI
  2019-02-26
球型核酸(spherical nucleic acids)被認為是一種具有革新性的新藥,這種微型粒子在免疫療法中扮演了重要的角色,具有治療很多疾病的前景。但是,在這之前,科學(xué)家們還需要克服很多難題。

       球型核酸(spherical nucleic acids)被認為是一種具有革新性的新藥,這種微型粒子在免疫療法中扮演了重要的角色,具有治療很多疾病的前景。但是,在這之前,科學(xué)家們還需要克服很多難題。

      近日,美國西北 大學(xué)(Northwestern University)的一個團隊采用機器學(xué)習(xí)算法,尋找到了更直接的優(yōu)化球型核酸篩選和合成的方法,在使用免疫療法治療癌癥、遺傳性疾病和神經(jīng)系統(tǒng)疾病的道路上更進一步。研究論文刊登在近期出版的《Nature Biomedical Engineering》上。

      球型核酸的發(fā)現(xiàn)者,西北大學(xué)的化學(xué)家Chad A. Mirkin博士介紹說:“目前已經(jīng)有五種使用了球型核酸技術(shù)的新藥進入了人體臨床試驗階段。這些藥所涉及的疾病包括惡性膠質(zhì)瘤(最常見的腦部腫瘤)和銀屑?。ㄅFぐ_)。”

      顧名思義,球型核酸的結(jié)構(gòu)呈現(xiàn)為一個球形,外表面有含有DNA和RNA的成分??茖W(xué)家可以對球型核酸進行編輯,使其具有關(guān)閉特定基因和細胞活性的功能,以實現(xiàn)個性化治療。近期,也有研究通過激活人體內(nèi)的免疫系統(tǒng)來治療特定疾?。ㄈ绨┌Y)的**。因此,這種療法又稱為免疫療法。

      盡管球型核酸有在諸多不同疾病中發(fā)揮功效的潛力,發(fā)現(xiàn)和合成這種粒子卻并不容易。想要化發(fā)揮球型核酸的功能,需要對其大小、成分、DNA序列等進行優(yōu)化,這些特性的細微變化都會影響其激活特定免疫反應(yīng)的效果,甚至導(dǎo)致其生物活性不明顯。

      新研究采用了名為SAMDI-MS的技術(shù),一次性篩選了1000種不同的球型核酸結(jié)構(gòu)。緊接著,研究人員使用高通量方法(high-throughput method)和質(zhì)譜分析(mass spectrometry assay)快速測量了球型核酸的免疫激活效果。最后,機器學(xué)習(xí)算法可以根據(jù)球型核酸的免疫激活進行定量建模,并確定能達到”結(jié)構(gòu)—活性關(guān)系“所需的最小球形核酸數(shù)量。

      新方法將會大大加快球型核酸的合成、測量和分析進度,減少不必要的步驟,助力新藥的研發(fā)。藥物研發(fā)者可以根據(jù)機器學(xué)習(xí)對球型核酸結(jié)構(gòu)功能的分析,對不同球型核酸進行排序?;诖耍邪l(fā)者還能建立一套基于效用的球型核酸設(shè)計規(guī)則,從而加快針對特定疾病的免疫療法藥物研發(fā)進程。

      新研究成果再次展現(xiàn)了機器學(xué)習(xí)解決復(fù)雜生物問題的能力,Mirkin博士表示:“這可以使研究者專注精力于最有潛力的球型核酸結(jié)構(gòu),以最終研發(fā)出強大的癌癥療法”。

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