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CPHI制藥在線 資訊 科學家Nature發(fā)文,有望助力新型抗生素研發(fā)

科學家Nature發(fā)文,有望助力新型抗生素研發(fā)

作者:藥明康德  來源:學術(shù)經(jīng)緯
  2018-05-07
研究人員們發(fā)現(xiàn),一款代號為G907的小分子抑制劑能與MsbA多個保守跨膜域之間的空間契合,而結(jié)合了G907的MsbA無法完成執(zhí)行生理功能所需的關(guān)鍵構(gòu)象轉(zhuǎn)變。這從結(jié)構(gòu)上回答了G907的一大抑制機理。

       全世界范圍內(nèi),新型抗生素的缺乏已經(jīng)帶來了嚴重的公共衛(wèi)生危機,而針對革蘭氏陰性菌的抗生素新藥研發(fā)則一直困難重重。在最新一期的《自然》雜志上,科學家們面對這一難題做出了突破。

       在介紹這項研究前,我們先來了解一下革蘭氏陰性菌。這類細菌的致病性更高,常見的大腸桿菌就屬于這一范疇。與革蘭氏陽性菌不同,革蘭氏陰性菌有兩層細胞膜(外膜與內(nèi)膜)。因此,想要有效地針對革蘭氏陰性菌,抗生素需要穿透的防護要來得更多。

       在革蘭氏陰性菌體外,一類叫做脂多糖(lipopolysaccharide)的物質(zhì)是擋在抗生素面前的一大障礙。而將脂多糖運輸?shù)礁锾m氏陰性菌表面,又離不開一種叫做MsbA的轉(zhuǎn)運蛋白。因此,研究人員們自然而然地想到,如果我們能抑制MsbA的功能,也許就能帶來新型抗生素研發(fā)上的轉(zhuǎn)機。

革蘭氏陰性菌有著復雜的細胞膜結(jié)構(gòu)

       革蘭氏陰性菌有著復雜的細胞膜結(jié)構(gòu)

       從300萬個候選藥物中,研究人員們篩選出了多個能特異抑制大腸桿菌MsbA的小分子。利用X射線晶體衍射的方法,他們又進一步獲得了MsbA與這些小分子抑制劑結(jié)合時的高清結(jié)構(gòu),分辨率達到了2.9?。而這些高清結(jié)構(gòu)也為后續(xù)的研究帶來了洞見——研究人員們發(fā)現(xiàn),一款代號為G907的小分子抑制劑能與MsbA多個保守跨膜域之間的空間契合,而結(jié)合了G907的MsbA無法完成執(zhí)行生理功能所需的關(guān)鍵構(gòu)象轉(zhuǎn)變。這從結(jié)構(gòu)上回答了G907的一大抑制機理。

       有趣的是,進一步的研究發(fā)現(xiàn),G907居然還有第二種抑制MsbA的機制。在細菌中,MsbA的正常工作需要水解ATP產(chǎn)生的能量,因此MsbA結(jié)構(gòu)中的核酸結(jié)合域(nucleotide-binding domain)對其功能而言至關(guān)重要。而G907與MsbA的結(jié)合,可以影響到核酸結(jié)構(gòu)域,從而對MsbA產(chǎn)生變構(gòu)上的抑制。

       研究人員們指出,這項研究有望用于一大類轉(zhuǎn)運蛋白抑制劑(統(tǒng)稱ATP結(jié)合盒轉(zhuǎn)運蛋白,或ABC轉(zhuǎn)運蛋白)的設(shè)計。與常規(guī)的ABC轉(zhuǎn)運蛋白抑制劑不同,G907及其類似物并不會與轉(zhuǎn)運的底物發(fā)生競爭性抑制,而是通過結(jié)構(gòu)上的抑制,影響MsbA的功能。

       在文章的最后,研究人員們也提到,ABC轉(zhuǎn)運蛋白家族成員具有較高的結(jié)構(gòu)保守性,這項研究有望帶來全新的選擇性抑制劑,為新型抗生素的研發(fā)提供洞見與協(xié)助。我們期待創(chuàng)新抗生素能早日問世,為全球公共衛(wèi)生做出貢獻!

       原始出處:

       Hoangdung Ho,et al.Structural basis for dual-mode inhibition of the ABC transporter MsbA.Nature.02 May 2018

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