【新型基因組平臺揭示了新的HIV目標(biāo)】來自斯坦福大學(xué)的研究人員開發(fā)了首次高通量、基于基因組的成像方法來研究蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性。該方法已被用于鑒定HIV降解以增強(qiáng)其感染過程的幾種未知的人類蛋白質(zhì)。該平臺被稱為全球陣列蛋白穩(wěn)定性分析(GAPSA)，能夠識別驅(qū)動細(xì)胞中蛋白質(zhì)的破壞的電路，并且具有廣泛的應(yīng)用，以鑒定用于諸如阿爾茨海默病、癌癥、自身免疫性疾病和感染性疾病的全新治療目標(biāo)。這項(xiàng)研究今天發(fā)表在《細(xì)胞報告》中。
研究人員表示：“我們已經(jīng)使用GAPSA來發(fā)現(xiàn)HIV-1輔助蛋白Vpu靶向的宿主蛋白，這是病毒復(fù)制的關(guān)鍵，我們選擇VPU作為測試用例，因?yàn)楸M管已知一些VPU目標(biāo)，但我們懷疑有更多的VPU目標(biāo)。事實(shí)上，GAPSA能夠確定幾種具有抗病毒活性的宿主蛋白，這些蛋白沒有與HIV相關(guān)報道。”
VPU是針對先天免疫反應(yīng)的HIV的武器，是身體對病原體的第一道防線。VPU觸發(fā)了防止HIV感染的宿主蛋白的降解，從而幫助病毒克服感染和復(fù)制的障礙。
“在這項(xiàng)研究中，我們篩選了一組433個干擾素刺激基因（ISG），針對感染，針對VPU激活的基因，建立更全面的HIV細(xì)胞目標(biāo)列表。鑒定VPU靶蛋白可為尋找阻斷相互作用、潛在地保留宿主抗病毒蛋白和限制HIV感染的新藥物創(chuàng)造機(jī)會。重要的是，該系統(tǒng)同樣適用于其它逃避免疫系統(tǒng)的傳染病，如埃博拉、流感等。”
“根據(jù)我們的知識，Gaspan是第一個以細(xì)胞為基礎(chǔ)的陣列平臺，用來篩選蛋白質(zhì)的構(gòu)建和周轉(zhuǎn)。除了提供細(xì)胞工作原理的關(guān)鍵知識外，還可以應(yīng)用該技術(shù)來鑒定特異性靶向致病蛋白的蛋白降解物，這可以為多種疾病提供新的治療機(jī)會。
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