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CPHI制藥在線 資訊 1株南極來源真菌 Arthrinium arundinis 的次級(jí)代謝產(chǎn)物研究

1株南極來源真菌 Arthrinium arundinis 的次級(jí)代謝產(chǎn)物研究

來源:藥智網(wǎng)
  2023-11-29
南極位于地球最南端,氣候嚴(yán)寒,風(fēng)力凜冽,太陽輻射強(qiáng)烈,生存條件嚴(yán)苛,其特有的凍層海洋環(huán)境使其蘊(yùn)藏著十分獨(dú)特的微生物資源[1]。為了適應(yīng)極地特有的環(huán)境,這些微生物在基因的轉(zhuǎn)錄、蛋白的表達(dá)及代謝調(diào)控方面有著獨(dú)特的機(jī)制,具有產(chǎn)生結(jié)構(gòu)新穎活性化合物的潛力[2-4]。文獻(xiàn)研究表明,節(jié)菱孢屬真菌Arthrinium sp.能夠產(chǎn)生多樣的次級(jí)代謝產(chǎn)物,涵蓋了苯并色原酮類[5-6]、香豆素類[7-8]、生物堿類[9-10]、萜類[11]、甾體類[12]等,且這些化合物具有抗菌、抗病毒、細(xì)胞毒等生物活性。

       南極位于地球最南端,氣候嚴(yán)寒,風(fēng)力凜冽,太陽輻射強(qiáng)烈,生存條件嚴(yán)苛,其特有的凍層海洋環(huán)境使其蘊(yùn)藏著十分獨(dú)特的微生物資源[1]。為了適應(yīng)極地特有的環(huán)境,這些微生物在基因的轉(zhuǎn)錄、蛋白的表達(dá)及代謝調(diào)控方面有著獨(dú)特的機(jī)制,具有產(chǎn)生結(jié)構(gòu)新穎活性化合物的潛力[2-4]。文獻(xiàn)研究表明,節(jié)菱孢屬真菌Arthrinium sp.能夠產(chǎn)生多樣的次級(jí)代謝產(chǎn)物,涵蓋了苯并色原酮類[5-6]、香豆素類[7-8]、生物堿類[9-10]、萜類[11]、甾體類[12]等,且這些化合物具有抗菌、抗病毒、細(xì)胞毒等生物活性。

       本研究對(duì)南極來源真菌Arthrinium arundinis(FNJ20)的次級(jí)代謝產(chǎn)物及其生物活性開展研究,從中分離鑒定出1個(gè)新構(gòu)型的二萜類化合物(–)arthrinin A(1),5個(gè)已知二萜類化合物libertellenone J(2),arthrinins B(3),arthrinin D(4),myrocin A(5),myrocin E(6)以及2個(gè)苯并色原酮類化合物conioxanthone A(7),1,3,6-tri-hydroxy-8-methylxanthone(8)(見圖1),并對(duì)化合物進(jìn)行了抗菌活性評(píng)價(jià)。

《中國(guó)海洋藥物》

       01

       實(shí)驗(yàn)部分

       1.1儀器與試劑

       LaChrom Elite高效液相色譜儀(日本日立公司);Micromass Q-TOF質(zhì)譜儀(美國(guó)Waters公司);Agilent DD2 500 MHz型核磁共振波譜儀(美國(guó)Agilent公司);X-單晶衍射儀(德國(guó)Bruker公司);Laborota 2 000/4 000旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀(德國(guó)Heidoph公司);MIR-253 SANYO恒溫培養(yǎng)箱(上海精宏實(shí)驗(yàn)設(shè)備有限公司);酶聯(lián)免疫檢測(cè)儀(奧地利Tecan公司);LDZX-50KBS高壓蒸汽滅菌鍋(上海申安醫(yī)療器械廠);Sephadex LH-20凝膠色譜填料(美國(guó)Amersham公司);硅膠(200~300目,青島海洋化學(xué)公司)。

       酵母膏,瓊脂,葡萄糖,甘油,DMSO(國(guó)藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司);環(huán)丙沙星(上海麥克林生化科技有限公司,生產(chǎn)批號(hào)201424);高效液相色譜儀專用色譜純甲醇(天津四友精細(xì)化工公司);氘代試劑(美國(guó)CIL公司);提取分離所用甲醇、乙酸乙酯、二氯甲烷、石油醚等均為工業(yè)純產(chǎn)品。

       1.2菌株來源

       菌株分離自南極海泥。經(jīng)過真菌形態(tài)和ITS序列比對(duì),確定為真菌Arthrinium arundinis。目前該菌株保存于中國(guó)海洋大學(xué)海洋藥用生物資源室,菌株編號(hào)為FNJ20,于甘油中?80℃保存。

       1.3菌株發(fā)酵

       從節(jié)菱孢屬真菌A.arundinis(FNJ20)菌種凍存管中,將菌種接種到土豆培養(yǎng)基(PDA)平板上復(fù)蘇,然后將平板上復(fù)蘇好的菌株瓊脂小塊接種到大米固體培養(yǎng)基(30 g大米,30 g/1 000 mL的海水約30 mL)中,共發(fā)酵200瓶,室溫靜置培養(yǎng)45d。

       1.4提取與分離

       將發(fā)酵后的菌體用乙酸乙酯浸泡3次,再用二氯甲烷-甲醇(體積比1∶1)浸泡1次,濃縮得到浸膏(270 g)。首先用減壓柱對(duì)浸膏梯度洗脫,最終獲得5個(gè)組分(Fr.1~5)。組分Fr.2經(jīng)過正相柱色譜分離、凝膠柱色譜Sephadex LH-20(洗脫體系為石油醚-二氯甲烷-甲醇,體積比2∶1∶1)分離得到組分Fr.2.1~2.3,組分Fr.2.1經(jīng)過半制備型高效液相色譜(甲醇-水,體積比9∶1,流速2 mL/min)制備得到化合物1(18.9 mg)。組分Fr.2.3經(jīng)過半制備型高效液相色譜(甲醇-水,體積比9∶1,流速2 mL/min)制備得到化合物2(15.5 mg)。將組分Fr.3經(jīng)過硅膠柱色譜分離、凝膠柱層析Sephadex LH-20(洗脫體系為二氯甲烷-甲醇,1∶1),洗脫得到組分Fr.3.1~3.3。組分Fr.3.1經(jīng)半制備高效液相色譜(甲醇-水,體積比8∶2,流速2 mL/min)得到化合物3(9.8 mg)和4(9.2 mg)。組分Fr.3.2經(jīng)半制備高效液相色譜(甲醇-水,體積比8∶2,流速2 mL/min)得到化合物5(18.3 mg)和6(7.8 mg)。組分Fr.3.3經(jīng)半制備高效液相色譜(甲醇-水,體積比7∶3,流速2 mL/min)得到化合物7(15.0 mg)和8(8.2 mg)。

       1.5抗菌活性評(píng)價(jià)

       以微量稀釋法[13-14]進(jìn)行化合物的抗菌活性測(cè)定。測(cè)試菌株包括金黃色葡萄球菌(Staphyloccocus aureus)、大腸桿菌(Escherichia coli)、銅綠假單胞菌(Psmdomonas aeruginosa)、白色念珠菌(Candida albicans)。陽性對(duì)照為環(huán)丙沙星,陰性對(duì)照為DMSO溶液,每個(gè)化合物設(shè)置3個(gè)平行。

       02

       結(jié)果與討論

       2.1化合物的結(jié)構(gòu)鑒定

       化合物1:無色晶體,HRESIMS在m/z 327.158 9處給出[M+H]+峰,確定分子式為C20H22O4,不飽和度為10。在其1 H NMR和13C NMR譜中,δH 1.01(1H,t,J=4.40 Hz,H-20a)和δH 0.68(1H,dd,J=8.55,4.75 Hz,H-20b)處的氫信號(hào)及δC 14.5(C-20)、δC 21.3(C-1)和δC 23.3(C-10)處的碳信號(hào),提示了化合物1有環(huán)丙基結(jié)構(gòu)。此外,還有1個(gè)羰基信號(hào)(δC 182.7),1個(gè)末端乙烯基信號(hào)δC 136.1,δH 6.94(1H,dd,J=11.24,17.98 Hz,H-15);δC 120.7,δH 5.39(1H,dd,J=11.24,2.32 Hz,H-16a)和δH 5.10(1H,dd,J=17.98,2.32 Hz,H-16b),2個(gè)次甲基信號(hào)和2個(gè)甲基信號(hào)。根據(jù)以上的核磁數(shù)據(jù)推測(cè)化合物1為二萜類化合物,且該化合物的波譜數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報(bào)道已知化合物arthrinin A一致[15],由此1的平面結(jié)構(gòu)得以確定。以正己烷-甲醇(體積比1∶1)溶解化合物,室溫緩慢揮發(fā)溶劑獲得單晶,通過銅靶單晶衍射獲得其單晶數(shù)據(jù)(見圖2),并已經(jīng)提交到劍橋晶體數(shù)據(jù)中心,CCDC號(hào)為1992569。對(duì)單晶數(shù)據(jù)進(jìn)行分析確定化合物1的一定構(gòu)型為1S,4S,5R,6R,7R,10S,與文獻(xiàn)報(bào)道的arthrinin A的構(gòu)型相反,最終將化合物1命名為(–)-arthrinin A。

圖2 化合物1的晶體結(jié)構(gòu)圖

       化合物2~6:均為已知的二萜類化合物,其質(zhì)譜、核磁及旋光數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報(bào)道一致,分別確定為libertellenone J(2)[16],arthrinin B(3)[15],arthrinin D(4)[15],myrocin A(5)[17]和myrocinE(5)[16]。

       化合物7:白色粉末狀固體。ESI-MS在m/z 317處給出[M+H]+峰,提示分子質(zhì)量為316。1H NMR譜顯示了4個(gè)均為單峰的芳香氫信號(hào)(δH 6.73,6.74,6.82,6.94),13C NMR譜顯示了2個(gè)苯環(huán)上連羥基的碳信號(hào)(δC 162.9,167.9)和1個(gè)羰基碳信號(hào)(δC 181.0),這提示了苯并色原酮骨架的存在。另外,1H NMR和13C NMR譜還顯示了1個(gè)甲氧基(δC 53.6,δH 3.96),1個(gè)亞甲基(δC64.6,δH 4.67)的存在。結(jié)合以上信息,對(duì)比文獻(xiàn)[18]的核磁數(shù)據(jù),確定了化合物為conioxanthone A?;衔?:黃色粉末狀固體。ESI-MS在m/z259處給出[M+H]+峰,提示分子質(zhì)量為258。其1H NMR和13C NMR數(shù)據(jù)與7的相似,也顯示了苯并色原酮骨架特征信號(hào)。結(jié)合以上信息,對(duì)比文獻(xiàn)[19]的核磁數(shù)據(jù),確定了化合物為1,3,6-tri-hydroxy-8-methylxanthone。

       2.2化合物波譜數(shù)據(jù)

       Arthrinin A(1):C20H22O4,1 H NMR(500 MHz,Methanol-d4,δ,J/Hz)δH 6.94(1H,dd,J=11.24,17.98 Hz,H-15),6.48(1H,s,H-12),5.39(1H,dd,J=11.24,2.32 Hz,H-16a),5.24(1H,d,J=7.76 Hz,H-7),5.10(1H,dd,J=17.98,2.32 Hz,H-16b),4.52(1H,dd,J=11.94,7.76 Hz,H-6),3.18(1H,ddt,J=8.91,4.11,2.56 Hz,H-1),2.19(1H,d,J=11.94 Hz,H-5),2.16(3H,s,H-17),2.03(1H,m,H-2a),1.83(1H,dq,J=14.08,3.10 Hz,H-2b),1.57(1H,td,J=13.73,3.75 Hz,H-3a),1.43(1H,m,H-3b),1.27(3H,s,H-18),1.01(1H,t,J=4.40 Hz,H-20a),0.68(1H,dd,J=8.55,4.75 Hz,H-20b)。13C NMR(125 MHz,Methanol-d4,δ)δC 182.7(C-19),150.2(C-11),139.2(C-8),136.1(CH-15),135.0(C-13),132.4(C-14),129.9(C-9),120.7(CH2-16),117.3(CH-12),84.9(CH-6),74.4(CH-7),47.0(CH-5),39.1(C-4),27.8(CH3-18),23.3(C-10),22.8(CH2-3),21.3(CH-1),20.5(CH2-2),20.2(CH3-17),14.5(CH2-20)。HRESIMS m/z 327.158 9[M+H]+,m/z 349.140 8[M+Na]+,m/z 365.115 1[M+K]+,[α]2 5 D–7.87(c=0.1,MeOH)。

       Libertellenone J(2):C21H28O6,1 H NMR(500MHz,Methanol-d4,δ,J/Hz)δH 7.00(1H,d,J=1.87 Hz,H-14),5.93(1H,dd,J=17.49,10.67 Hz,H-15),5.13(1H,dd,J=17.49,1.05 Hz,H-16a),5.06(1H,dd,J=10.67,1.05 Hz,H-16b),4.35(1H,dd,J=10.95,4.76 Hz,H-1),3.64(3H,s,H-21)2.23(1H,td,J=14.50,3.32 Hz,H-11a),2.10(1H,dt,J=14.50,3.32 Hz,H11b),1.96(1H,dd,J=13.13,3.88 Hz,H-3a),1.88(1H,m,H-2),1.81(1H,m,H-12),1.65(1H,ddd,J=12.83,4.21,2.18 Hz,H-3b),1.57(1H,m,H-12),1.50(3H,s,H-18),1.22(3H,s,H-20),1.16(3H,s,H-17)。13C NMR(151 MHz,Methanol-d4,δ)δC 182.9(C-7),180.3(C19),148.9(CH-14),147.6(CH-15),146.1(C-6),140.5(C-5),135.9(C-8),112.8(CH2-16),76.4(C-9),69.7(CH-1),52.9(CH3-21),50.3(C-10),47.6(C-4),39.7(C-13),35.3(CH2-3),31.0(CH2-12),29.8(CH2-11),28.7(CH2-2),23.8(CH3-17),22.3(CH3-18),22.9(CH3-20)。ESI-MS m/z:377[M+H]+,[α]2 5 D–32.7(c=0.1,MeOH)。

       Arthrinin B(3):C20H22O3,1 H NMR(500 MHz,Methanol-d4,δ,J/Hz)δH 7.00(1H,s,H-14),6.61(1H,dd,J=18.08,11.50 Hz,H-15),5.60(1H,dd,J=11.50,1.99 Hz,H-16b),5.41(1H,dd,J=18.08,1.99 Hz,H-16a),4.93(1H,d,J=8.71 Hz,H-7),4.43(1H,dd,J=11.41,8.71 Hz,H-6),3.16(1H,ddt,J=9.00,4.16,2.56 Hz,H-1),2.27(1H,d,J=11.41 Hz,H-5),2.22(3H,s,H-17),2.07(1H,td,J=13.83,3.35 Hz,H-2b),1.84(1H,dq,J=14.11,3.08 Hz,H-2a),1.60(1H,td,J=13.83,3.35 Hz,H-3a),1.46(1H,dt,J=14.11,3.08 Hz,H-3b),1.29(3H,s,H-18),1.02(1H,t,J=4.38 Hz,H-20a),0.60(1H,dd,J=8.60,4.71 Hz,H-20b)。13C NMR(125 MHz,Methanol-d4,δ)δC 183.6(C-19),149.0(C-11),139.1(C-8),133.4(C-13),131.5(CH-15),130.1(CH-9),125.2(C-12),122.7(CH-14),120.1(CH2-16),85.5(CH-6),75.5(CH-7),47.2(CH-5),39.0(C-4),27.1(CH3-18),23.6(C-10),22.7(CH2-3),21.3(CH-1),20.0(CH2-2),19.2(CH3-17),14.0(CH2-20)。ESIMS m/z 311[M+H]+,[α]2 5 D+14.2(c=0.1,MeOH)。

       Arthrinin D(4):C20H24O5,1 H NMR(500 MHz,Methanol-d4,δ,J/Hz)δH 6.73(1H,dd,J=17.84,11.34 Hz,H-15),6.56(1H,d,J=0.92 Hz,H-12),5.49(1H,dd,J=11.34,2.29 Hz,H-16a),5.34(1H,dd,J=17.84,2.29 Hz,H-16b),5.13(1H,s,H-7),3.58(1H,q,J=7.05 Hz,H-6),2.15(3H,s,H-17),2.32(1H,s,H-5),1.99(1H,tdd,J=12.49,4.54,2.48 Hz,H-3a),1.77(1H,m,H-3b),1.72(1H,dd,J=14.37,4.68 Hz,H-2a),1.45(1H,ddd,J=14.37,4.46,2.48 Hz,H-2b),1.38(3H,s,H-18),1.15(1H,t,J=7.05 Hz,H-1),0.89(1H,t,J=5.51 Hz,H=20a),0.43(1H,dd,J=8.43,5.89 Hz,H-20b)。13C NMR(125 MHz,Methanol-d4,δ)δC 183.3(C-19),152.3(C-11),137.3(C-9),134.6(C-14),134.2(CH-15),131.2(C-8),118.8(CH2-16),117.8(CH-12),72.0(CH-7),57.0(CH-6),52.6(CH-5),41.7(C-4),28.2(CH3-18),26.8(CH2-2),19.3(CH3-17),18.6(CH2-3),17.9(C-13),17.0(CH-1),16.6(C-10),14.3(CH2-20)。ESI-MS m/z:345[M+H]+,367[M+Na]+,[α]2 5 D+24.6(c=0.1,MeOH)。

       Myrocin A(5):C20H22O6,1 H NMR(500 MHz,Acetone-d6,δ,J/Hz)δH 6.83(1H,d,J=1.57 Hz,H-14),5.69(1H,dd,J=17.67,10.31 Hz,H-15),5.01(1H,d,J=1.38 Hz,H-16a),4.98(1H,dd,J=5.00,0.75 Hz,H-16b),2.90(1H,d,J=13.42 Hz,H-12a),2.52(1H,dd,J=13.42,1.57 Hz,H-12b),2.07(1H,m,H-2a),1.84(1H,m,H-2b),1.82(1H,m,H-3a),1.79(1H,m,H-1),1.44(1H,m,H-3b),1.43(3H,s,H-17),1.42(3H,s,H-19),1.09(1H,t,J=6.28 Hz,H-20a),0.83(1H,dd,J=8.97,6.28 Hz,H-20b)。13C NMR(125 MHz,Acetone-d6,δ)δC 208.8(C-11),182.9(C-7),177.8(C-19),145.1(C-6),143.8(CH-14),142.7(CH-15),137.5(C-8),132.6(C-5),115.2(CH2-16),76.7(C-9),53.9(CH2-12),44.9(C-4),43.3(C-13),29.8(CH2-3),27.6(C-10),27.5(CH3-17),20.0(CH3-18),18.2(CH2-2),16.9(CH-1),12.4(CH2-20)。ESI-MS m/z:359[M+H]+,381[M+Na]+,[α]2 5 D–32.1(c=0.1,MeOH)。

       Myrocin E(6):C20H24O6,1 H NMR(500 MHz,Acetone-d6,δ,J/Hz)δH 6.82(1H,d,J=1.43 Hz,H-14),5.83(1H,dd,J=17.47,10.57 Hz,H-15),5.03(1H,dd,J=17.47,1.10 Hz,H-16a),4.98(1H,dd,J=10.57,1.10 Hz,H-16b),3.91(1H,d,J=3.93 Hz,H-11),3.47(1H,d,J=1.13 Hz,H-5),2.87(1H,m,H-12a),2.36(1H,dd,J=14.27,2.49 Hz,H-1),1.78(1H,m,H-3a),1.76(1H,m,H-2a),1.74(1H,m,H-2b),1.66(1H,ddd,J=14.25,3.72,1.43 Hz,H-12b),1.48(3H,s,H-19),1.44(1H,m,H-3b),1.33(3H,s,H-17),0.63(1H,dd,J=6.33,3.99 Hz,H-20a),0.14(1H,t,J=14.87 Hz,H-20b)。13C NMR(125 MHz,Acetone-d6,δ)δC 193.3(C-7),182.9(C-18),148.4(CH-14),147.4(CH-15),133.7(C-8),112.3(CH2-16),97.2(C-6),72.7(C-9),69.4(CH-11),47.3(CH-5),41.8(C-4),39.7(C-13),39.1(CH2-12),29.7(CH3-19),29.6(CH2-3),27.2(CH3-17),25.1(C-10),19.5(CH2-2),14.4(CH-1),7.4(CH2-20)。ESI-MS m/z:361[M+H]+,383[M+Na]+,[α]2 5 D–8.37(c=0.1,MeOH)。

       Conioxanthone A(7):C16H12O7,1 H NMR(500 MHz,Methanol-d4,δ,J/Hz)δH 6.94(1H,s,H-4),6.82(1H,s,H-5),6.74(1H,s,H-7),6.73(1H,s,H-2),4.67(2H,s,H-10),3.96(3H,s,H-12)。13C NMR(125 MHz,Methanol-d4,δ)δC 181.0(C-9),171.7(C-11),167.9(C-6),162.9(C-1),160.1(C-5a),157.6(C-4a),153.6(C-3),136.7(C8),115.0(CH-7),109.0(CH-2),108.4(C-8a),108.1(C-1a),105.4(CH-4),104.7(CH-5),64.6(CH2-10),53.6(CH3-12)。ESIMS m/z:339[M+Na]+。

       1,3,6-trihydroxy-8-methylxanthone(8):C14H10O5,1 H NMR(500 MHz,Methanol-d4,δ,J/Hz)δH 6.57(1H,s,H-2),6.56(1H,s,H-4),6.08(1H,d,J=2.19 Hz,H-5),6.19(1H,d,J=2.19 Hz,H-7),2.74(3H,s,H-11)。13C NMR(125 MHz,Methanol-d4,δ)δC 183.6(C-9),166.2(C-6),165.0(C-8),164.4(C-3),161.0(C-4a),158.8(C-10a),144.9(C-1),117.2(CH-2),113.0(C-1a),104.2(C-9a),101.7(CH-4),99.0(CH-7),94.4(CH-5),23.7(CH3-11)。ESIMS m/z:259[M+H]+。

       2.3化合物1單晶數(shù)據(jù)

       C20H22O4(M),Mr=326.37,該晶體為單斜晶,所在空間群為P2(1);晶胞參數(shù)為a=10.199 8(5)?,b=7.157 7(4)?,c=11.739 4(6)?,α=90°,β=103.098(5)°,γ=90°,V=834.76(8),Z=2,Dcalc=1.298 g/cm3,μ(Cu Kα)=0.726 mm–1,F(xiàn)(000)=348.0。獨(dú)立衍射點(diǎn):5110(Rint=0.032 0)。R1值為0.038 6,flack常數(shù)為0.1(3),wR2=0.099 5[I>2σ(I)],化合物1的單晶數(shù)據(jù)已經(jīng)提交到劍橋單晶數(shù)據(jù)中心,CCDC號(hào)為1992569。

       2.4抗菌活性評(píng)價(jià)

       采用微量稀釋法對(duì)分離到的化合物進(jìn)行抗菌活性評(píng)價(jià)。結(jié)果顯示,化合物8具有對(duì)金黃色葡萄球菌和白色念珠菌顯著的抑制活性,MIC值分別為6.25和12.50μmol/L。陽性對(duì)照環(huán)丙沙星的MIC值為3.125μmol/L。

       03

       結(jié)論

       本研究從南極海泥來源節(jié)菱孢屬真菌A.arundinis(FNJ20)的發(fā)酵提取物中分離并鑒定了6個(gè)二萜類化合物(1~6)及2個(gè)苯并色原酮類化合物(7~8),并通過單晶確定了化合物1的一定構(gòu)型?;衔?對(duì)金黃色葡萄球菌和白色念珠菌有顯著的抑制活性,為該菌次級(jí)代謝產(chǎn)物的進(jìn)一步應(yīng)用提供了基礎(chǔ)資料。

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