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CPHI制藥在線 資訊 帶你了解病毒如何感染人類!人類-病毒蛋白質相互作用圖譜面世

帶你了解病毒如何感染人類!人類-病毒蛋白質相互作用圖譜面世

熱門推薦: 蛋白質 病毒 宿主細胞
來源:生物探索
  2019-09-05
病毒是一種比真菌和細菌小得多的感染性微生物,要想生存,它就必須找到合適的活體細胞作為“宿主”寄生于其內部,再利用復雜的蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)來強占宿主細胞的生存功能來汲取養(yǎng)分。

       近日,一部豆瓣評分9.2的韓國電影《寄生蟲》廣受大家的好評。故事也正如片名一樣,講述了一個貧困家庭“寄生”于富人家庭的故事。說到寄生,其實人體內的寄生事件更是數(shù)不勝數(shù),最常見的便是病毒的感染。

       病毒是一種比真菌和細菌小得多的感染性微生物,要想生存,它就必須找到合適的活體細胞作為“宿主”寄生于其內部,再利用復雜的蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)來強占宿主細胞的生存功能來汲取養(yǎng)分。宿主細胞也不甘示弱,也通過PPI來啟動激活先天抗病毒防御和適應性免疫系統(tǒng)來控制病毒復制。但在這場較量中,一旦被寄生的宿主細胞“戰(zhàn)亡”,在其體內迅速繁殖的大量“寄生”病毒便會傾斜而出,重新踏上新的“寄生”之旅,感染更多健康細胞。

要想生存,它就必須找到合適的活體細胞作為“宿主”寄生于其內部

       圖片來源:參考資料[1]

       因此,蛋白質與蛋白質相互作用(PPI)的相關知識對于理解病毒與宿主之間的關系至關重要。目前,科學家主要通過高通量方法來研究蛋白質間的相互作用,雖然獲取了很多新發(fā)現(xiàn),但這種方法在可擴展性方面的不足也限制了進一步的研究。

       8月29日,來自美國哥倫比亞大學醫(yī)學中心的生物學家在《Cell》雜志上所發(fā)表的一篇論文表示,研究人員已開發(fā)了一種新開發(fā)的計算框架,稱為P-HIPSTer。它能利用蛋白質結構信息推斷病毒蛋白和人類蛋白之間的相互作用,能有效彌補高通量方法擴展性不足的缺陷。

       研究人員表示,目前已通過P-HIPSTer對已知的1000余種可感染人類的病毒及其編碼的大約13000種蛋白質進行了研究。該算法預測了大約28.2萬個可能的相互作用蛋白對,其準確度接近80%,代表了人類-病毒蛋白質相互作用的綜合目錄。這一圖譜的誕生,標志著建立不同生物間物理相互作用綜合制圖的第一步,對人類免疫學和傳染病的進一步研究提供非凡的貢獻。

       除此之外,研究人員表示,通過P-HIPSTer他們還意外發(fā)現(xiàn)了大量關于病毒如何感染人類細胞并導致疾病的信息,包括雌激素受體在調節(jié)寨卡(ZIKA)病毒感染中的作用、人乳頭瘤(HPV)病毒如何導致癌癥、病毒如何影響人類基因組等等。

       該研究領導者哥倫比亞大學Vagelos醫(yī)生和外科醫(yī)生學院系統(tǒng)生物學系與和微生物學和免疫學系的助理教授Sagi Shapira博士表示,通過該研究所繪制的人類-病毒蛋白互作圖鑒,可以幫助科學家突破目前研究的瓶頸,更加深入地了解病毒蛋白質與人類蛋白質間相互作用。接下來,P-HIPSTer將被使用于一些更復雜病原體的得研究,如寄生蟲和細菌的研究;未來,關于農作物或牲畜的病毒或病原體的研究也會在P-HIPSTer技術的推動下不斷深入。

       參考資料:

       [1] A Structure-Informed Atlas of Human-Virus Interactions

       [2] Detailed Map Gives Scientists a New Window into how Human-Infecting Viruses Work

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