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CPHI制藥在線 資訊 環(huán)丙基在藥化中的一些應(yīng)用

環(huán)丙基在藥化中的一些應(yīng)用

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來(lái)源:藥渡
  2018-12-12
自1882年環(huán)丙烷環(huán)被合成以來(lái),環(huán)丙基以其特有的性質(zhì),在藥物化學(xué)中不斷地被廣泛使用,目前,在FDA批準(zhǔn)的上市藥物中,含有環(huán)丙基的藥物分子有60多個(gè)。

       自1882年環(huán)丙烷環(huán)被合成以來(lái),環(huán)丙基以其特有的性質(zhì),在藥物化學(xué)中不斷地被廣泛使用,目前,在FDA批準(zhǔn)的上市藥物中,含有環(huán)丙基的藥物分子有60多個(gè)。環(huán)丙烷的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)有:1,三個(gè)碳原子在同一個(gè)平面;2,相對(duì)較短的C-C鍵長(zhǎng);3,環(huán)丙基的C-C鍵不是單純的單鍵或雙鍵,而是在介于二種鍵之間,有類似于雙鍵的性質(zhì);4,環(huán)丙基中的C-C鍵比直鏈烷烴的C-C鍵的化學(xué)活性要高,鍵長(zhǎng)更短,鍵能更高。

       1.替代雙鍵(HCV NS5B 非核苷類抑制劑42)

       Gentles和他的同事們以化合物41為先導(dǎo)化合物進(jìn)行藥物結(jié)構(gòu)優(yōu)化。他們優(yōu)化出的化合物42(BMS-791325)具有很多方面的優(yōu)點(diǎn),比如1:在大環(huán)結(jié)構(gòu)中引入了剛性結(jié)構(gòu),使化合物42的構(gòu)象趨于穩(wěn)定;2:環(huán)丙基與HCV NS5B聚合酶的殘基高效的相互作用;3:消除了潛在的邁克爾受體(雙鍵)的反應(yīng)性能。一般說(shuō)來(lái),環(huán)丙基類似物的效力大于烯烴類似物,這可能是由于環(huán)丙基與Leu492(PDB ID 4NLD)的羰基氧骨架相互作用的結(jié)果。這些研究最終導(dǎo)致發(fā)現(xiàn)了臨床候選化合物42,目前該化合物正在進(jìn)行臨床3期試驗(yàn)。

       2.引入螺環(huán)結(jié)構(gòu)(GS-5885)

       吉利德公司在開(kāi)發(fā)HCV NS5A抑制劑過(guò)程中,發(fā)現(xiàn)了活性較好的化合物39,后續(xù)優(yōu)化中插入螺環(huán)-環(huán)丙基吡咯烷環(huán)來(lái)取代吡咯烷環(huán),從而產(chǎn)生最有效的HCV NS5A抑制劑化合物40。因此,螺環(huán)丙基取代基不僅對(duì)增強(qiáng)藥效和改善蛋白質(zhì)調(diào)節(jié)有重要作用,同時(shí)也優(yōu)化了PK性質(zhì)。

       3.引入稠環(huán)結(jié)構(gòu)(GEN-4997)

       基因泰克公司的研究人員首先發(fā)現(xiàn)了化合物68(GNE-9822),發(fā)現(xiàn)其對(duì)hERG鉀離子通道有明顯的抑制作用,但副作用較大。在后續(xù)優(yōu)化中,研究人員發(fā)現(xiàn)了化合物69,其對(duì)ITK酶活性有很好的抑制作用,但是化合物69與附近的親脂口袋之間的相互作用不夠強(qiáng),通過(guò)對(duì)化合物69的四氫吲唑骨架進(jìn)行改造,插入雙氟代環(huán)丙基得到化合物70(GNE-4997),極大的提高了化合物的生物活性。X射線共晶結(jié)構(gòu)可顯示環(huán)丙基的二氟乙烯部分與親脂口袋的有效空間填充。

       4.構(gòu)象受限組胺類似物的設(shè)計(jì)

       組胺和其他神經(jīng)遞質(zhì)一樣,具有多種構(gòu)象,這可能使其通過(guò)不同構(gòu)象與多種受體亞型結(jié)合成為可能。例如,與H3受體結(jié)合的構(gòu)象,即,H3亞型的生物活性構(gòu)象可能不同于H1、H2和/或H4亞型受體。同樣,H4亞型的生物活性構(gòu)象可能與其他受體亞型不同。因此,由于組胺構(gòu)象的限制可能改善對(duì)受體亞型之一的特異性結(jié)合,通過(guò)限制組胺構(gòu)象來(lái)開(kāi)發(fā)新的H3選擇性激動(dòng)劑。

       Shotu及其研究人員在咪唑側(cè)鏈上引入環(huán)丙基,設(shè)計(jì)了大量的構(gòu)象限制組胺類似物,實(shí)驗(yàn)活性測(cè)試發(fā)現(xiàn)化合物13具有選擇性的H3受體激動(dòng)劑,但是對(duì)H4受體則無(wú)激動(dòng)效應(yīng)。這些研究表明環(huán)丙基的構(gòu)象限制策略是一個(gè)很好地方法。

       5.惡唑烷酮的環(huán)丙基取代

       利奈唑胺(下圖1)和依哌唑胺(下圖2)是廣譜抗菌類藥物,Renslo及其研究人員對(duì)C環(huán)進(jìn)行優(yōu)化,引入環(huán)丙基從而改善該類藥物的活性,研究發(fā)現(xiàn)環(huán)丙并環(huán)戊胺的改變,具有了芳雜環(huán)的一些特性,使該類化合物對(duì)大多數(shù)革蘭氏陽(yáng)性及革蘭氏陰性菌都有良好的抑制作用。

       當(dāng)然,環(huán)丙基在藥物化學(xué)中的其他應(yīng)用還有很多,比如在J. Med.Chem. 2008, 51, 6581?6591中用環(huán)丙基取代乙基,大大提高了分子的生物利用度;在Bioorg. Med. Chem.Lett. 2003, 13, 4007?4010中用環(huán)丙基取代苯環(huán),降低了分子的親脂性,得到了更優(yōu)的Lck靶點(diǎn)的抑制劑。

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