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口服FXa抑制劑——利伐沙班是如何設(shè)計的?

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作者:道拓  來源:藥渡
  2018-09-26
卒中、心肌梗死、深靜脈血栓塞 (DVT)及相關(guān)并發(fā)癥等心腦血管疾病已成為影響公眾健康的主要殺手之一 。在美國,每年約有20萬血管栓塞的新增病例;西歐則有超過100萬人患病,有37萬人死于血管栓塞及其相關(guān)疾病。

       卒中、心肌梗死、深靜脈血栓塞 (DVT)及相關(guān)并發(fā)癥等心腦血管疾病已成為影響公眾健康的主要殺手之一 。在美國,每年約有20萬血管栓塞的新增病例;西歐則有超過100萬人患病,有37萬人死于血管栓塞及其相關(guān)疾病。該病的發(fā)病率也與年齡相關(guān),在30-49歲,血管栓塞的發(fā)病率為每千人中2人發(fā)病,但在70-79歲之間則達(dá)到了每千人中20人發(fā)病。

       在利伐沙班出現(xiàn)之前,臨床經(jīng)常使用的抗凝藥物為維生素K類抗凝劑及肝素,但它們均存在局限性,開發(fā)強(qiáng)效、穩(wěn)定、耐受性好的的新型口服小分子抗凝藥是研究的熱點。而活化因子FXa (Factor Xa)受到了人們的關(guān)注,它是一種絲氨酸蛋白酶,可將凝血酶原轉(zhuǎn)化為凝血酶,是一個極具價值的抗凝作用靶點,它在內(nèi)源性和外源性兩條凝血途徑的會聚點發(fā)揮作用,處于內(nèi)源或外源通路的中心位置,現(xiàn)已成為開發(fā)新一代抗凝藥物的主要靶點。FXa抑制劑則可阻止凝血酶的突增,減少凝血酶誘導(dǎo)的凝血和血小板的激活,且無傳統(tǒng)抗凝劑所具有的局限性 。

       FXa抑制劑的發(fā)現(xiàn)與設(shè)計

       在1987年,第一個FXa抑制劑——Antistasin,在墨西哥水蛭中分離出來。1990年,又有人在蜱蟲中分離出蜱蟲抗凝多肽(TAP)。與Antistasin類似,TAP也是FXa的強(qiáng)效抑制劑,凝血實驗表明,F(xiàn)Xa在體外能夠活化凝血酶原促使形成凝集,F(xiàn)Xa抑制劑具有很強(qiáng)的抗凝血作用,并且治療窗口較寬,具有成為新一代抗凝藥物的潛力。

       1998年,拜耳公司組建研發(fā)團(tuán)隊開始著手小分子FXa抑制劑的研究,經(jīng)過對200000種化合物的高通量篩選,得到苗頭化合物1——通過組合化學(xué)庫得到的含有磷酸鹽基團(tuán)的小分子化合物,它的IC50 值為70nM。將其中的磷酸鹽基團(tuán)由脒基替換,形成苗頭化合物2,它的IC50 值為120nM。

       為了降低脒基的堿性和離解性,變換成弱堿性或中性基團(tuán),使其有利于吸收,增加化合物活性,研發(fā)人員合成了異吲哚啉類化合物3與4,它們的IC50值分別為2nM與8nM。雖然它們的IC50值足夠小,但是生物利用度也是很低,這就極大阻礙了化合物藥效的發(fā)揮。

       故而,在此基礎(chǔ)上又合成了活性稍低的化合物5,該化合物的IC50 值為48 nM,在大鼠實驗中,測得其口服生物利用度為38%。雖然生物利用度提高了,但是整體效果仍然不理想。

       合成了諸多化合物都未達(dá)到理想狀態(tài),研發(fā)人員不得不重新考慮一味地尋找活性高的化合物這一思路是否正確。為了驗證化合物基團(tuán)的重要性,他們總結(jié)得出苯脒基并不是必要的,化合物3,4,5均沒有這一基團(tuán)。利用構(gòu)效關(guān)系得出,這些化合物右邊的氯噻吩甲酰胺基則是非常重要的。于是,他們重新關(guān)注那些活性低的化合物,以期發(fā)現(xiàn)有用的化合物。

       在二次篩查后,他們發(fā)現(xiàn)了兩個惡唑烷酮類化合物6與7。其中化合物6是很弱的FXa抑制劑,其IC50值為20000nM。7與6的不同在于7化合物中的噻吩上的氫原子被氯原子取代,這樣,它的IC50值提高了200多倍,為90nM。雖然它們的活性不高,但是這類化合物有很好的生物利用度。通過這兩個例子可以說明:噁唑烷酮片段對整個化合物的影響是有利的,因為它提高了化合物的溶解性與生物利用度;噻吩環(huán)的氯代對提高化合物的生物活性也很重要。于是,研發(fā)人員將化合物7作為先導(dǎo)化合物進(jìn)行進(jìn)一步地優(yōu)化。

       用嗎啉環(huán)置換硫代嗎啉環(huán), 化合物8活性提高近2倍, IC50為32nM;用四氫吡咯替換, 化合物9的IC50為40nM。雖然化合物8沒有最強(qiáng)的活性,但它展示了最完美的藥物動力學(xué)結(jié)果,口服生物利用度高達(dá)94%。

       在嗎啉環(huán)與四氫吡咯中引入羰基,得到化合物10與11。引入羰基之后,化合物活性明顯提高,生物利用度降低的也不多?;衔?0與11的IC50 值分別為4nM與0.7nM;它們的口服生物利用度分別為65%與60%。但是在大鼠的體內(nèi)實驗在,化合物10的活性卻變低了,而化合物11無論在體內(nèi)還是在體外實驗均表現(xiàn)出良好的活性。且11的R對映體的 IC50 = 2300nM,證明S構(gòu)型是構(gòu)型。因此,最終的候選化合物為11,這也是后來的首個口服FXa抑制劑——利伐沙班(rivaroxaban)。該藥在2008年9月在歐盟和加拿大上市,2011年7月由美國FDA批準(zhǔn)上市。

       利伐沙班與FXa的構(gòu)效關(guān)系

       為了理解驗證利伐沙班與FXa的相互作用,X射線衍射提供了很大的幫助,它有助于幫助解決利伐沙班與FXa的構(gòu)效關(guān)系問題。

       在晶體結(jié)構(gòu)中,利伐沙班與Gly219 形成兩個重要的氫鍵,惡唑烷酮的羰基與Gly219形成強(qiáng)氫鍵結(jié)合 (2.0Å),氯代噻吩環(huán)上酰胺的 NH 與 Gly219形成弱氫鍵結(jié)合 (3.3Å)。這兩個氫鍵支持著惡唑烷酮進(jìn)入FXa的S1與S4口袋,這就導(dǎo)致了S 構(gòu)型的惡唑烷酮采取了 L-形狀的構(gòu)象。

       FXa中的Tyr99,Phe174 與Trp215組成包含S4的狹窄疏水口袋,利伐沙班的嗎啉酮部分正好“夾在”Tyr99和Phe174之間,而其芳基環(huán)取向垂直地延伸穿過Trp215的表面。嗎啉酮羰基和FXa 沒有直接相互作用關(guān)系,只是有助于嗎啉酮的平面化,使得嗎啉酮部分更好地進(jìn)入口袋。

       氯代噻吩環(huán)結(jié)合于 S1 腔,氯原子與 Tyr228 的苯環(huán)發(fā)生鹵素-π 電子的相互作用,與 Asp189 在S1 腔中形成的靜電相互作用。這顯然增加利伐沙班的活性與生物利用度。

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