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CPHI制藥在線 資訊 面對(duì)**之殤 -- Nature文章告訴你如何高效實(shí)現(xiàn)**研發(fā)

面對(duì)**之殤 -- Nature文章告訴你如何高效實(shí)現(xiàn)**研發(fā)

熱門(mén)推薦: Fluidigm **之殤 RotaShield
來(lái)源:富魯達(dá)(上海)儀器科技有限公司
  2018-08-06
月底的中國(guó),已進(jìn)入一年中最炎熱的季節(jié),同樣熱起來(lái)的還有人們對(duì)**的關(guān)注。7月21日,一篇《**之王》的文章在各大網(wǎng)站上瘋狂轉(zhuǎn)載,同時(shí)刷爆了朋友圈。

       月底的中國(guó),已進(jìn)入一年中最炎熱的季節(jié),同樣熱起來(lái)的還有人們對(duì)**的關(guān)注。7月21日,一篇《**之王》的文章在各大網(wǎng)站上瘋狂轉(zhuǎn)載,同時(shí)刷爆了朋友圈。文章爆料出了許多**行業(yè)令人咂舌的內(nèi)幕。雖然具體事件還未考證,但因?yàn)殚L(zhǎng)生生物"狂犬病**造假"引發(fā)的一系列事件卻持續(xù)發(fā)酵,與長(zhǎng)生生物一起登上黑榜的還有武漢生物,同時(shí)這一事件也把整個(gè)**行業(yè)甚至生物制藥行業(yè)推上了風(fēng)口浪尖,據(jù)《覽富財(cái)經(jīng)》數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì),至7月23日收盤(pán),生物醫(yī)藥板塊118只個(gè)股有90只處于下跌狀態(tài),其中41只跌幅超過(guò)5%。

       中國(guó)大多數(shù)人,特別是"九零"前的人,胳膊上方都會(huì)有一個(gè)或大或小的疤痕,那是"種痘"留下的痕跡。用這種方法預(yù)防天花早在公元10世紀(jì)的我國(guó)唐宋年間就已有記載。隨著現(xiàn)代**技術(shù)的發(fā)展,至上世紀(jì)80年代,天花這種曾經(jīng)禍害四方的疾病在全球范圍內(nèi)基本已經(jīng)被徹底鏟除。

       不僅僅是在天花,在中國(guó)歷史上,麻疹、白喉、猩紅熱、鼠疫、霍亂、傷寒、痢疾等等病毒都曾肆虐一時(shí),奪去了無(wú)數(shù)人的生命。為了戰(zhàn)勝各種病毒,科學(xué)家們研制了不同的**,將人類從病毒的魔爪中拯救出來(lái)。拋開(kāi)那些無(wú)良商家不談,今天我們能依靠**有效預(yù)防多種疾病,離不開(kāi)無(wú)數(shù)科研人員的無(wú)私奉獻(xiàn)。

       **研發(fā)的兩難困境:如何平衡多數(shù)人的利益和少數(shù)人的風(fēng)險(xiǎn)?

       然而正如"人無(wú)完人",任何一件事物都不會(huì)是完美的,當(dāng)科學(xué)家在研發(fā)新**的過(guò)程中審視數(shù)據(jù)、去試著評(píng)估一個(gè)**的收益和風(fēng)險(xiǎn)時(shí),經(jīng)常處于兩難困境:如何平衡多數(shù)人的利益和少數(shù)人的風(fēng)險(xiǎn)?**能保護(hù)大眾、尤其使廣大兒童免于嚴(yán)重疾病,但是在少數(shù)情況下,又會(huì)造成危害。

       以RotaShield**為例,它是第一個(gè)獲得批準(zhǔn)對(duì)抗輪狀病毒感染的**。這種常見(jiàn)病毒會(huì)在年幼的兒童身上引發(fā)嚴(yán)重腹瀉,每年都有數(shù)十萬(wàn)兒童死于這種感染。RotaShield是1998年在美國(guó)獲得批準(zhǔn)的。但是一年之后, Wyeth Laboratories進(jìn)行了召回,因?yàn)橛袔醉?xiàng)研究顯示接種了RotaShield的兒童有更高的風(fēng)險(xiǎn)(1-2/萬(wàn)名)患上腸套疊(intussusception),一種腸道阻塞病,治療不及時(shí)可能致命。

       雖然在發(fā)展中國(guó)家RotaShield挽救的生命遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)它引起的腸套疊病例,然而這種**的命運(yùn)已經(jīng)被封死了。直至六年后,才有另一個(gè)比較安全的輪狀病毒**進(jìn)入市場(chǎng),而在這六年里,每年又有超過(guò)50萬(wàn)名兒童因?yàn)檩啝畈《径馈?/p>

 

       《Nature Biotechnology》:從上百種可能的抗原表位中快速篩選出有效部分

       在輪狀病毒**的研發(fā)過(guò)程中,由于只發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)抗原表位,導(dǎo)致**研發(fā)嚴(yán)重滯后。Nature Biotechnology上曾經(jīng)發(fā)表一篇高效篩選抗原表位的研究成果,來(lái)自斯坦福的科學(xué)家利用Fluidigm公司的CYTOF質(zhì)譜流式技術(shù),結(jié)合組合肽-MHC四聚體染色方法開(kāi)發(fā)出一種新的多參數(shù)高通量檢測(cè)方法[ref 1],由于質(zhì)譜流式技術(shù)利用金屬代替熒光基團(tuán)作為標(biāo)簽,將單次檢測(cè)通道擴(kuò)大至幾十甚至上百個(gè),在此基礎(chǔ)上,研究人員利用3元標(biāo)簽進(jìn)行排列組合(利用10種標(biāo)簽中的3種進(jìn)行排列組合,然后利用不同的組合標(biāo)簽標(biāo)記不同的四聚體),僅僅利用一管人血液樣本,即對(duì)109種可能的抗原表位同時(shí)進(jìn)行篩選,并且還同時(shí)分析了該樣本中的23種和T細(xì)胞表型、功能相關(guān)的蛋白標(biāo)志物。通過(guò)這一方法,科學(xué)家快速找到了6個(gè)HLA-A*0201限制性T細(xì)胞抗原表位,極大提高了單次篩選的效率和準(zhǔn)確性。

       事實(shí)上,不僅僅是輪狀病毒**,在所有新**的研發(fā)中,有效抗原表位的稀缺和高效篩選一直是令科學(xué)家們愁眉不展的原因之一,特別是象腫瘤這種高度異質(zhì)性、持續(xù)動(dòng)態(tài)變化的疾病類型。

       好在隨著腫瘤免疫研究的深入及DNA測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,在原有預(yù)防性**的基礎(chǔ)上,科學(xué)家們不斷開(kāi)發(fā)出了治療型的腫瘤個(gè)體化**,用于有效治療黑色素瘤等重大疾病。來(lái)自美國(guó)波士頓Dana-Farber癌癥中心和德國(guó)美因茨大學(xué)的兩個(gè)研究團(tuán)隊(duì)同時(shí)在《自然》雜志上發(fā)表論文[ref2、3],展示了針對(duì)腫瘤的"個(gè)性化**"臨床試驗(yàn),取得重大突破。

       兩個(gè)試驗(yàn)都是針對(duì)黑色素瘤,都是選取的3期或4期的中晚期患者,復(fù)發(fā)高危人群。結(jié)果讓人欣喜,兩個(gè)團(tuán)隊(duì)都顯示,60%-70%的患者在接種**后,腫瘤沒(méi)有復(fù)發(fā),即使復(fù)發(fā)的患者,一部分在使用PD1免疫療法后,腫瘤也再次消失!更重要的是,使用**的患者,體內(nèi)針對(duì)癌細(xì)胞的特異免疫反應(yīng)也大幅增強(qiáng)!

       兩個(gè)項(xiàng)目所采用的方法也有近似之處,首先對(duì)患者腫瘤組織樣本進(jìn)行取樣測(cè)序,并分別使用自己獨(dú)特的算法預(yù)測(cè)哪些突變最有可能引起免疫反應(yīng)。然后分別開(kāi)發(fā)出了以多肽片段和RNA為基礎(chǔ)的**,并在晚期黑色素瘤3期或4期的中晚期復(fù)發(fā)高危人群身上展開(kāi)了研究。

       研究中兩個(gè)小組不約而同的采用了一種高通量基因檢測(cè)系統(tǒng)--Biomark HD系統(tǒng)。該系統(tǒng)可對(duì)多達(dá)96個(gè)患者樣本、每個(gè)樣本96個(gè)位點(diǎn)(96.96)進(jìn)行同時(shí)檢測(cè),在4小時(shí)內(nèi)實(shí)現(xiàn)近萬(wàn)個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)的分析,并將每個(gè)反應(yīng)控制在納升(nl)級(jí)體系內(nèi)。在上述兩個(gè)研究中,其中一項(xiàng)用Biomark HD系統(tǒng)對(duì)正常和腫瘤組織中的95個(gè)SNP位點(diǎn)進(jìn)行了基因分析檢測(cè),以確保樣本的準(zhǔn)確性;另一項(xiàng)研究中對(duì)接種**前、后,腫瘤樣本中的免疫基因表達(dá)水平變化進(jìn)行了細(xì)致分析,從細(xì)胞因子、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、表型和代謝機(jī)理等多角度對(duì)**療效進(jìn)行綜合評(píng)估(圖1) 。

 

       不僅是Fluidigm公司的Biomark HD系統(tǒng),在今年年初《Nature》上發(fā)表的題為"technology to watch in 2018"的文章中[ref 4],來(lái)自世界頂尖學(xué)府和研究機(jī)構(gòu)的專家學(xué)者們就2018年將會(huì)對(duì)生命科學(xué)領(lǐng)域產(chǎn)生重大影響的多項(xiàng)先進(jìn)技術(shù)進(jìn)行了介紹,其中之一就是關(guān)于上文中提到的Fluidigm公司的CYTOF質(zhì)譜流式技術(shù),該技術(shù)將會(huì)在未來(lái)大幅推進(jìn)腫瘤**的研究和應(yīng)用。

       Reference:

       1.Combinatorial tetramer staining and mass cytometry analysis facilitate T-cell epitope mapping and characterization. Newell EW., Sigal N., Nair N. et al. Nature Biotechnology (2013): 623-9

       2.An immunogenic personal neoantigen vaccine for patients with melanoma. Ott PA, et al., Nature (2017) doi: 10.1038/nature22991.

       3.Personalized RNA mutanome vaccines mobilize poly-specific therapeutic immunity against cancer. Sahin U, et al., Nature (2017) doi: 10.1038/nature23003.

       4.https://www.nature.com/articles/d41586-018-01021-5

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