瑞肝素鈉是用豬的腸黏膜獲得的肝素鈉的亞硝酸解聚作用制備的。組分的大部分在非還原端有一個(gè)2-Ｏ-sulfo-α-L-idopyranosuronic酸結(jié)構(gòu)，而還原端有一個(gè)6-鄰－磺基-2，5-去水-甘露醇結(jié)構(gòu)。平均分子質(zhì)量在3150～5150之間，特征值大約是4150。每一個(gè)二糖單位硫酸鹽化作用程度大約是2.1。
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